Halbeeg Cusub oo loogu talagalay Soo saarista DNA-da Biyaha Deegaanka - Taxanaha Bigefei wuxuu dardar gelinayaa Cilmi-baarista Sayniska

Qalabkani wuxuu ku salaysan yahay nidaam kaydin oo la habeeyay oo ay weheliso kuul birlabeed nano ah oo waxqabad sare leh. DNA-da genomic waxay si gaar ah ugu xidhaa kooxaha shaqeeya ee dusha sare ee kuusha waxaana lagu kala saaraa goob birlabeed oo dibadda ah. Ka dib tallaabooyin badan oo jilicsan oo lagu dhaqo si looga saaro borotiinnada, cusbada, iyo wasakhda kale, DNA-da genomic ee saafiga ah ugu dambeyntii waa la soo saaraa.

Si gaar ah loogu talagalay muunadaha biyaha deegaanka, qalabkani wuxuu si hufan u soo saaraa DNA-da bakteeriyada ee laga soo ururiyey xuubka shaandhada, oo ay ku jiraan bakteeriyada Gram-negative iyo Gram-positive (ilaa 2 × 10⁹ unugyada bakteeriyada halkii xuub shaandho). Waxay la jaanqaadaysaa nidaamyada soo saarista aashitada nucleic-ga oo si buuxda isu-gudbisa si loogu farsameeyo wax-soo-saar sare. DNA-da la soo saaray waa mid tayo joogto ah leh waxaana si toos ah loogu isticmaali karaa PCR/qPCR, NGS, iyo codsiyada kale ee hoose.

Tilmaamaha Badeecada

1. Awoodda Soo Saarista Bakteeriyada ee Balaadhan

Si hufan ayuu bakteeriyada Gram-negative iyo Gram-positive uga soo saaraa muunadaha biyaha, isagoo daboolaya bulshooyinka microbial-ka ee badanaa laga helo deegaannada biyaha macaan iyo kuwa badda, wuxuuna daboolayaa shuruudaha falanqaynta ee kala duwan.

2. Nadiifin Sare iyo Wax-soo-saar Sare

Waxay bixisaa DNA-da oo leh nadiifnimo sare, ka xor ah wasakhda xakamaynta, iyo wax soo saar deggan oo ku habboon codsiyada molikulada ee tooska ah ee hoose.

3. Iswaafajinta otomaatiga ah iyo hufnaanta sare

Si buuxda ula jaanqaadaysa nidaamyada soo saarista aashitada nukliyeerka ee otomaatiga ah ee Bigfish, iyagoo taageeraya habaynta isku mar ah ee 32 ama 96 muunadood, si weyn u yareeya waqtiga habaynta iyo hagaajinta hufnaanta shaybaarka.

4. Hawlgal Ammaan ah oo Isticmaale-saaxiibtinimo leh

Looma baahna walxo sun ah oo dabiici ah sida phenol ama kloroform, taasoo yaraynaysa khataraha badbaadada shaybaarka. Waxyaabaha asaasiga ah waxaa lagu sii diyaariyaa saxanno 96-bool ah, taasoo yaraynaysa khaladaadka tuubooyinka gacanta lagu sameeyo iyo fududeynta socodka shaqada.

Qalabka Iswaafajiya

Bigfish BFEX-16E

BFEX-32

BFEX-32E

BFEX-96E

Natiijooyinka Tijaabada

Muunad biyaha webiga ah oo 600 mL ah ayaa lagu shaandheeyay xuub, DNA-dana waxaa laga soo saaray iyadoo la adeegsanayo qalabka soo saarista iyo nadiifinta DNA-da deegaanka ee ku salaysan Bigfish magnetic magnetic oo ay weheliso qalabka la jaanqaadaya. DNA-da la soo saaray waxaa markii dambe lagu falanqeeyay electrophoresis gel agarose.